Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFMP49411 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFMP49411 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFMP49411 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFMP49411 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFMP49411 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFMP49411 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFMP49411 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFMP49411 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFMP49411 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFMP49411 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFMP49411 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFMP49411 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUFMP49411 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUFMP49411 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUFMP49411 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUFMP49411 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUFMP49411 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUFMP49411 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUFMP49411 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUFMP49411 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUFMP49411 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TUFMP49411 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUFMP49411 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUFMP49411 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUFMP49411 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFMP49411 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFMP49411 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFMP49411 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFMP49411 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFMP49411 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFMP49411 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFMP49411 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFMP49411 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFMP49411 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFMP49411 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFMP49411 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUFMP49411 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TUFMP49411 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUFMP49411 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUFMP49411 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUFMP49411 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUFMP49411 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFMP49411 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFMP49411 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFMP49411 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFMP49411 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFMP49411 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFMP49411 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFMP49411 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFMP49411 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFMP49411 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFMP49411 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFMP49411 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFMP49411 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFMP49411 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFMP49411 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFMP49411 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFMP49411 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFMP49411 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFMP49411 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFMP49411 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFMP49411 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFMP49411 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFMP49411 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFMP49411 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFMP49411 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFMP49411 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFMP49411 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFMP49411 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFMP49411 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFMP49411 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFMP49411 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFMP49411 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFMP49411 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFMP49411 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFMP49411 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFMP49411 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFMP49411 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFMP49411 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFMP49411 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFMP49411 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFMP49411 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFMP49411 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFMP49411 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFMP49411 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFMP49411 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFMP49411 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFMP49411 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFMP49411 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFMP49411 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFMP49411 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFMP49411 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFMP49411 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFMP49411 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFMP49411 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFMP49411 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFMP49411 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUFMP49411 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUFMP49411 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms