Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTBP49356 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTBP49356 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTBP49356 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTBP49356 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTBP49356 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTBP49356 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTBP49356 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTBP49356 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTBP49356 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTBP49356 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTBP49356 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTBP49356 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTBP49356 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTBP49356 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTBP49356 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTBP49356 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTBP49356 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTBP49356 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTBP49356 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTBP49356 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTBP49356 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTBP49356 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTBP49356 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTBP49356 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTBP49356 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTBP49356 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTBP49356 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTBP49356 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTBP49356 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTBP49356 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTBP49356 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTBP49356 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTBP49356 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTBP49356 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTBP49356 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTBP49356 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTBP49356 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTBP49356 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTBP49356 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTBP49356 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTBP49356 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTBP49356 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTBP49356 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTBP49356 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTBP49356 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTBP49356 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTBP49356 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTBP49356 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTBP49356 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTBP49356 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTBP49356 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTBP49356 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTBP49356 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTBP49356 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTBP49356 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTBP49356 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTBP49356 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTBP49356 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTBP49356 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTBP49356 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTBP49356 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTBP49356 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTBP49356 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTBP49356 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTBP49356 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTBP49356 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTBP49356 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTBP49356 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTBP49356 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTBP49356 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTBP49356 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTBP49356 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTBP49356 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTBP49356 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTBP49356 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTBP49356 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTBP49356 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTBP49356 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTBP49356 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTBP49356 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTBP49356 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTBP49356 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTBP49356 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTBP49356 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTBP49356 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTBP49356 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTBP49356 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTBP49356 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTBP49356 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTBP49356 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FNTBP49356 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNTBP49356 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNTBP49356 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNTBP49356 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNTBP49356 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FNTBP49356 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNTBP49356 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNTBP49356 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FNTBP49356 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms