Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIP4K2AP48426 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms