Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A11P48066 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC6A11P48066 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC6A11P48066 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC6A11P48066 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A11P48066 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A11P48066 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A11P48066 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A11P48066 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A11P48066 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A11P48066 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A11P48066 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A11P48066 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A11P48066 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A11P48066 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A11P48066 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A11P48066 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms