Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTX2P47972 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms