Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD4P46934 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms