Protein–RNA interactions for Protein: P46109

CRKL, Crk-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRKLP46109 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRKLP46109 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRKLP46109 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRKLP46109 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRKLP46109 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRKLP46109 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRKLP46109 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRKLP46109 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRKLP46109 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRKLP46109 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRKLP46109 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRKLP46109 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRKLP46109 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRKLP46109 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRKLP46109 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRKLP46109 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRKLP46109 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CRKLP46109 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CRKLP46109 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRKLP46109 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRKLP46109 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRKLP46109 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRKLP46109 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRKLP46109 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRKLP46109 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CRKLP46109 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRKLP46109 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRKLP46109 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRKLP46109 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRKLP46109 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRKLP46109 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRKLP46109 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRKLP46109 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRKLP46109 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CRKLP46109 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CRKLP46109 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRKLP46109 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRKLP46109 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRKLP46109 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRKLP46109 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRKLP46109 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRKLP46109 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRKLP46109 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRKLP46109 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CRKLP46109 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRKLP46109 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRKLP46109 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRKLP46109 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRKLP46109 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRKLP46109 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRKLP46109 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CRKLP46109 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRKLP46109 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CRKLP46109 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRKLP46109 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRKLP46109 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRKLP46109 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRKLP46109 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRKLP46109 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRKLP46109 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRKLP46109 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRKLP46109 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CRKLP46109 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRKLP46109 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRKLP46109 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRKLP46109 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRKLP46109 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRKLP46109 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRKLP46109 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRKLP46109 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CRKLP46109 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRKLP46109 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRKLP46109 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CRKLP46109 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRKLP46109 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRKLP46109 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRKLP46109 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CRKLP46109 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CRKLP46109 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CRKLP46109 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CRKLP46109 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CRKLP46109 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CRKLP46109 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRKLP46109 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRKLP46109 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRKLP46109 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CRKLP46109 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRKLP46109 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CRKLP46109 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CRKLP46109 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CRKLP46109 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRKLP46109 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CRKLP46109 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRKLP46109 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRKLP46109 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CRKLP46109 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRKLP46109 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CRKLP46109 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CRKLP46109 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CRKLP46109 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms