Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOP2P46087 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOP2P46087 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOP2P46087 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NOP2P46087 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOP2P46087 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOP2P46087 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOP2P46087 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOP2P46087 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NOP2P46087 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOP2P46087 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOP2P46087 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOP2P46087 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOP2P46087 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOP2P46087 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOP2P46087 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOP2P46087 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NOP2P46087 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NOP2P46087 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NOP2P46087 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NOP2P46087 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NOP2P46087 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NOP2P46087 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NOP2P46087 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NOP2P46087 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NOP2P46087 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOP2P46087 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOP2P46087 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOP2P46087 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOP2P46087 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOP2P46087 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOP2P46087 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOP2P46087 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOP2P46087 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOP2P46087 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOP2P46087 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOP2P46087 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOP2P46087 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOP2P46087 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOP2P46087 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOP2P46087 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOP2P46087 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOP2P46087 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOP2P46087 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOP2P46087 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOP2P46087 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOP2P46087 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOP2P46087 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOP2P46087 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOP2P46087 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOP2P46087 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOP2P46087 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOP2P46087 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOP2P46087 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOP2P46087 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOP2P46087 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOP2P46087 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOP2P46087 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOP2P46087 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOP2P46087 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOP2P46087 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOP2P46087 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOP2P46087 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOP2P46087 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NOP2P46087 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOP2P46087 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOP2P46087 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOP2P46087 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOP2P46087 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOP2P46087 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOP2P46087 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOP2P46087 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NOP2P46087 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOP2P46087 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOP2P46087 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOP2P46087 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOP2P46087 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOP2P46087 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOP2P46087 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOP2P46087 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOP2P46087 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOP2P46087 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOP2P46087 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOP2P46087 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOP2P46087 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOP2P46087 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOP2P46087 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOP2P46087 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOP2P46087 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOP2P46087 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOP2P46087 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOP2P46087 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOP2P46087 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOP2P46087 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOP2P46087 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOP2P46087 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NOP2P46087 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NOP2P46087 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NOP2P46087 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOP2P46087 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms