Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms