Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP2P42575 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP2P42575 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP2P42575 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP2P42575 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP2P42575 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP2P42575 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP2P42575 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP2P42575 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP2P42575 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP2P42575 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP2P42575 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP2P42575 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP2P42575 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP2P42575 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP2P42575 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP2P42575 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP2P42575 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP2P42575 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP2P42575 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP2P42575 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP2P42575 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP2P42575 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP2P42575 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP2P42575 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP2P42575 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP2P42575 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP2P42575 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP2P42575 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP2P42575 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP2P42575 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP2P42575 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP2P42575 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP2P42575 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP2P42575 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP2P42575 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP2P42575 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP2P42575 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP2P42575 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP2P42575 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP2P42575 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP2P42575 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP2P42575 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP2P42575 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP2P42575 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP2P42575 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP2P42575 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP2P42575 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP2P42575 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP2P42575 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP2P42575 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP2P42575 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP2P42575 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP2P42575 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP2P42575 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP2P42575 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP2P42575 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP2P42575 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP2P42575 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP2P42575 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP2P42575 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP2P42575 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP2P42575 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP2P42575 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP2P42575 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP2P42575 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP2P42575 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP2P42575 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP2P42575 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP2P42575 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP2P42575 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP2P42575 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP2P42575 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP2P42575 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP2P42575 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP2P42575 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP2P42575 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP2P42575 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP2P42575 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP2P42575 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP2P42575 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP2P42575 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP2P42575 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP2P42575 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP2P42575 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP2P42575 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP2P42575 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP2P42575 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP2P42575 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP2P42575 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP2P42575 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP2P42575 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP2P42575 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP2P42575 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP2P42575 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP2P42575 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP2P42575 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP2P42575 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP2P42575 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP2P42575 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms