Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms