Protein–RNA interactions for Protein: P37023

ACVRL1, Serine/threonine-protein kinase receptor R3, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVRL1P37023 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVRL1P37023 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVRL1P37023 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVRL1P37023 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVRL1P37023 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVRL1P37023 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVRL1P37023 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVRL1P37023 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVRL1P37023 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVRL1P37023 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVRL1P37023 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVRL1P37023 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVRL1P37023 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVRL1P37023 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms