Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms