Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP5C1P36542 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms