Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX5P35711 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX5P35711 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX5P35711 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX5P35711 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX5P35711 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX5P35711 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX5P35711 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX5P35711 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX5P35711 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX5P35711 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX5P35711 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX5P35711 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX5P35711 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX5P35711 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX5P35711 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX5P35711 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX5P35711 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX5P35711 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX5P35711 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX5P35711 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX5P35711 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX5P35711 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX5P35711 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX5P35711 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX5P35711 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX5P35711 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX5P35711 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX5P35711 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX5P35711 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX5P35711 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX5P35711 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX5P35711 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX5P35711 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX5P35711 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX5P35711 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX5P35711 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX5P35711 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX5P35711 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX5P35711 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX5P35711 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX5P35711 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX5P35711 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX5P35711 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX5P35711 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX5P35711 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX5P35711 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX5P35711 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX5P35711 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX5P35711 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX5P35711 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX5P35711 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX5P35711 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX5P35711 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX5P35711 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX5P35711 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX5P35711 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX5P35711 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX5P35711 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX5P35711 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX5P35711 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX5P35711 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX5P35711 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX5P35711 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX5P35711 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX5P35711 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX5P35711 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX5P35711 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX5P35711 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX5P35711 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX5P35711 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX5P35711 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX5P35711 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX5P35711 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX5P35711 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX5P35711 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX5P35711 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX5P35711 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX5P35711 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX5P35711 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX5P35711 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOX5P35711 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOX5P35711 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX5P35711 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX5P35711 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX5P35711 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX5P35711 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX5P35711 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX5P35711 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX5P35711 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX5P35711 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX5P35711 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX5P35711 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX5P35711 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX5P35711 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX5P35711 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX5P35711 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX5P35711 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX5P35711 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX5P35711 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms