Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD13P35453 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms