Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms