Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DSG3P32926 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DSG3P32926 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DSG3P32926 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DSG3P32926 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSG3P32926 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSG3P32926 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSG3P32926 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSG3P32926 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSG3P32926 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DSG3P32926 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSG3P32926 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DSG3P32926 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSG3P32926 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSG3P32926 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSG3P32926 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSG3P32926 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG3P32926 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG3P32926 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG3P32926 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG3P32926 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG3P32926 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG3P32926 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG3P32926 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG3P32926 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG3P32926 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG3P32926 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG3P32926 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG3P32926 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG3P32926 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG3P32926 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG3P32926 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG3P32926 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG3P32926 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG3P32926 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG3P32926 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG3P32926 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG3P32926 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG3P32926 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG3P32926 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG3P32926 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG3P32926 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG3P32926 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG3P32926 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DSG3P32926 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DSG3P32926 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSG3P32926 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSG3P32926 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSG3P32926 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DSG3P32926 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSG3P32926 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSG3P32926 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSG3P32926 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSG3P32926 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSG3P32926 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSG3P32926 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSG3P32926 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSG3P32926 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSG3P32926 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSG3P32926 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSG3P32926 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSG3P32926 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSG3P32926 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG3P32926 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG3P32926 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG3P32926 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG3P32926 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG3P32926 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG3P32926 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG3P32926 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG3P32926 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG3P32926 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG3P32926 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG3P32926 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG3P32926 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG3P32926 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG3P32926 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG3P32926 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG3P32926 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG3P32926 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG3P32926 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG3P32926 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG3P32926 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG3P32926 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG3P32926 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG3P32926 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG3P32926 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG3P32926 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG3P32926 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG3P32926 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG3P32926 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSG3P32926 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSG3P32926 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSG3P32926 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSG3P32926 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSG3P32926 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSG3P32926 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSG3P32926 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DSG3P32926 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSG3P32926 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms