Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP1P32455 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP1P32455 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP1P32455 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP1P32455 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP1P32455 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP1P32455 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP1P32455 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP1P32455 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP1P32455 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP1P32455 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP1P32455 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP1P32455 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP1P32455 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP1P32455 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP1P32455 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP1P32455 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP1P32455 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP1P32455 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP1P32455 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP1P32455 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP1P32455 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP1P32455 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP1P32455 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP1P32455 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP1P32455 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP1P32455 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP1P32455 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP1P32455 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP1P32455 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GBP1P32455 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP1P32455 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GBP1P32455 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP1P32455 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GBP1P32455 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP1P32455 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GBP1P32455 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP1P32455 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GBP1P32455 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GBP1P32455 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GBP1P32455 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP1P32455 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP1P32455 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP1P32455 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GBP1P32455 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP1P32455 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP1P32455 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP1P32455 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP1P32455 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP1P32455 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP1P32455 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP1P32455 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP1P32455 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP1P32455 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP1P32455 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP1P32455 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP1P32455 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP1P32455 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP1P32455 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP1P32455 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP1P32455 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP1P32455 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP1P32455 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP1P32455 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP1P32455 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP1P32455 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP1P32455 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP1P32455 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP1P32455 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP1P32455 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP1P32455 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP1P32455 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP1P32455 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP1P32455 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP1P32455 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP1P32455 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP1P32455 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP1P32455 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP1P32455 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP1P32455 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP1P32455 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP1P32455 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP1P32455 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP1P32455 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP1P32455 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP1P32455 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP1P32455 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP1P32455 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP1P32455 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP1P32455 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP1P32455 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP1P32455 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP1P32455 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP1P32455 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP1P32455 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP1P32455 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GBP1P32455 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP1P32455 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP1P32455 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP1P32455 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms