Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms