Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms