Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CLIP1P30622 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms