Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EPHB2P29323 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms