Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBL1P28749 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBL1P28749 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBL1P28749 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBL1P28749 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBL1P28749 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBL1P28749 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBL1P28749 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBL1P28749 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBL1P28749 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBL1P28749 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBL1P28749 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBL1P28749 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBL1P28749 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBL1P28749 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBL1P28749 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBL1P28749 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBL1P28749 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBL1P28749 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBL1P28749 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBL1P28749 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RBL1P28749 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBL1P28749 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBL1P28749 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBL1P28749 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBL1P28749 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBL1P28749 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBL1P28749 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBL1P28749 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBL1P28749 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBL1P28749 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBL1P28749 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBL1P28749 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBL1P28749 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RBL1P28749 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBL1P28749 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBL1P28749 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBL1P28749 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBL1P28749 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBL1P28749 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBL1P28749 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBL1P28749 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBL1P28749 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RBL1P28749 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBL1P28749 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBL1P28749 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBL1P28749 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBL1P28749 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBL1P28749 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBL1P28749 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBL1P28749 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBL1P28749 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RBL1P28749 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBL1P28749 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBL1P28749 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBL1P28749 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBL1P28749 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBL1P28749 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBL1P28749 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBL1P28749 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBL1P28749 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBL1P28749 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBL1P28749 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBL1P28749 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBL1P28749 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBL1P28749 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBL1P28749 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBL1P28749 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBL1P28749 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBL1P28749 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBL1P28749 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBL1P28749 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBL1P28749 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBL1P28749 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBL1P28749 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBL1P28749 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBL1P28749 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBL1P28749 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBL1P28749 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBL1P28749 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RBL1P28749 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RBL1P28749 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBL1P28749 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RBL1P28749 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBL1P28749 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBL1P28749 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBL1P28749 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBL1P28749 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBL1P28749 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBL1P28749 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBL1P28749 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBL1P28749 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBL1P28749 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBL1P28749 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBL1P28749 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBL1P28749 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBL1P28749 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBL1P28749 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBL1P28749 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBL1P28749 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms