Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLD1P28340 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLD1P28340 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLD1P28340 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLD1P28340 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLD1P28340 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLD1P28340 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLD1P28340 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLD1P28340 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
POLD1P28340 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLD1P28340 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLD1P28340 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
POLD1P28340 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLD1P28340 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLD1P28340 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLD1P28340 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLD1P28340 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLD1P28340 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLD1P28340 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
POLD1P28340 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLD1P28340 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLD1P28340 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
POLD1P28340 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLD1P28340 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLD1P28340 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLD1P28340 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
POLD1P28340 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLD1P28340 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLD1P28340 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLD1P28340 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLD1P28340 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLD1P28340 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLD1P28340 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLD1P28340 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLD1P28340 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
POLD1P28340 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLD1P28340 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLD1P28340 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLD1P28340 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLD1P28340 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLD1P28340 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLD1P28340 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLD1P28340 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLD1P28340 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLD1P28340 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLD1P28340 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLD1P28340 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLD1P28340 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLD1P28340 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLD1P28340 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLD1P28340 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLD1P28340 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLD1P28340 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLD1P28340 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLD1P28340 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLD1P28340 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLD1P28340 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLD1P28340 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLD1P28340 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLD1P28340 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLD1P28340 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLD1P28340 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLD1P28340 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLD1P28340 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
POLD1P28340 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLD1P28340 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLD1P28340 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLD1P28340 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLD1P28340 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLD1P28340 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
POLD1P28340 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLD1P28340 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLD1P28340 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLD1P28340 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLD1P28340 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLD1P28340 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLD1P28340 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLD1P28340 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLD1P28340 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLD1P28340 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLD1P28340 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLD1P28340 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLD1P28340 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLD1P28340 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLD1P28340 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLD1P28340 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLD1P28340 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLD1P28340 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLD1P28340 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
POLD1P28340 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLD1P28340 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
POLD1P28340 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLD1P28340 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLD1P28340 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLD1P28340 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLD1P28340 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLD1P28340 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLD1P28340 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLD1P28340 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLD1P28340 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms