Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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