Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms