Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B1P20020 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms