Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NFKB1P19838 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFKB1P19838 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms