Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATF3P18847 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
ATF3P18847 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ATF3P18847 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATF3P18847 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATF3P18847 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATF3P18847 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATF3P18847 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATF3P18847 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATF3P18847 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATF3P18847 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATF3P18847 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATF3P18847 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ATF3P18847 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATF3P18847 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATF3P18847 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATF3P18847 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATF3P18847 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATF3P18847 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATF3P18847 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATF3P18847 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATF3P18847 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATF3P18847 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ATF3P18847 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATF3P18847 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATF3P18847 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATF3P18847 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATF3P18847 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATF3P18847 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ATF3P18847 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATF3P18847 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATF3P18847 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATF3P18847 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATF3P18847 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ATF3P18847 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATF3P18847 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATF3P18847 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ATF3P18847 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATF3P18847 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ATF3P18847 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATF3P18847 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ATF3P18847 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATF3P18847 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATF3P18847 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATF3P18847 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATF3P18847 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATF3P18847 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATF3P18847 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATF3P18847 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATF3P18847 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ATF3P18847 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ATF3P18847 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATF3P18847 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATF3P18847 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ATF3P18847 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATF3P18847 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATF3P18847 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATF3P18847 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATF3P18847 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATF3P18847 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATF3P18847 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATF3P18847 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATF3P18847 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATF3P18847 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATF3P18847 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATF3P18847 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ATF3P18847 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
ATF3P18847 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATF3P18847 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATF3P18847 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATF3P18847 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATF3P18847 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ATF3P18847 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATF3P18847 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATF3P18847 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATF3P18847 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATF3P18847 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATF3P18847 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATF3P18847 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATF3P18847 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATF3P18847 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATF3P18847 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATF3P18847 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATF3P18847 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ATF3P18847 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATF3P18847 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ATF3P18847 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATF3P18847 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ATF3P18847 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATF3P18847 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATF3P18847 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATF3P18847 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATF3P18847 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATF3P18847 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATF3P18847 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATF3P18847 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATF3P18847 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATF3P18847 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATF3P18847 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATF3P18847 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms