Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTPS1P17812 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms