Protein–RNA interactions for Protein: P17693

HLA-G, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain G, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-GP17693 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-GP17693 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms