Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA1P17302 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA1P17302 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA1P17302 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA1P17302 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA1P17302 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA1P17302 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA1P17302 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA1P17302 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA1P17302 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA1P17302 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA1P17302 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA1P17302 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA1P17302 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA1P17302 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA1P17302 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA1P17302 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA1P17302 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA1P17302 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA1P17302 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA1P17302 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA1P17302 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA1P17302 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA1P17302 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA1P17302 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA1P17302 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA1P17302 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA1P17302 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA1P17302 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA1P17302 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA1P17302 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA1P17302 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA1P17302 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA1P17302 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA1P17302 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA1P17302 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA1P17302 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA1P17302 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA1P17302 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA1P17302 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA1P17302 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA1P17302 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA1P17302 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA1P17302 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA1P17302 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA1P17302 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA1P17302 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA1P17302 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA1P17302 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA1P17302 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA1P17302 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA1P17302 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA1P17302 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA1P17302 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA1P17302 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA1P17302 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA1P17302 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA1P17302 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA1P17302 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA1P17302 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA1P17302 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA1P17302 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA1P17302 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA1P17302 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA1P17302 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA1P17302 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA1P17302 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA1P17302 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA1P17302 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA1P17302 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA1P17302 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA1P17302 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA1P17302 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA1P17302 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA1P17302 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA1P17302 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA1P17302 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA1P17302 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA1P17302 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA1P17302 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA1P17302 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA1P17302 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA1P17302 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA1P17302 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA1P17302 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA1P17302 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA1P17302 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA1P17302 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA1P17302 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA1P17302 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA1P17302 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA1P17302 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA1P17302 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA1P17302 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA1P17302 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA1P17302 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA1P17302 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA1P17302 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA1P17302 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA1P17302 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms