Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTLA4P16410 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms