Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAV1P15498 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAV1P15498 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAV1P15498 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAV1P15498 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VAV1P15498 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAV1P15498 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAV1P15498 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAV1P15498 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAV1P15498 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAV1P15498 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAV1P15498 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAV1P15498 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAV1P15498 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAV1P15498 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAV1P15498 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAV1P15498 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAV1P15498 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAV1P15498 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAV1P15498 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VAV1P15498 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VAV1P15498 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VAV1P15498 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VAV1P15498 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VAV1P15498 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VAV1P15498 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VAV1P15498 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VAV1P15498 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAV1P15498 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAV1P15498 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAV1P15498 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VAV1P15498 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAV1P15498 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAV1P15498 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAV1P15498 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAV1P15498 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAV1P15498 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAV1P15498 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAV1P15498 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAV1P15498 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAV1P15498 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAV1P15498 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAV1P15498 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAV1P15498 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAV1P15498 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAV1P15498 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAV1P15498 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAV1P15498 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAV1P15498 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAV1P15498 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAV1P15498 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VAV1P15498 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAV1P15498 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAV1P15498 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VAV1P15498 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAV1P15498 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAV1P15498 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAV1P15498 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAV1P15498 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAV1P15498 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAV1P15498 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAV1P15498 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAV1P15498 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAV1P15498 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAV1P15498 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAV1P15498 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAV1P15498 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAV1P15498 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAV1P15498 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAV1P15498 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAV1P15498 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAV1P15498 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAV1P15498 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAV1P15498 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAV1P15498 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAV1P15498 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAV1P15498 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAV1P15498 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAV1P15498 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAV1P15498 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAV1P15498 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAV1P15498 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAV1P15498 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VAV1P15498 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAV1P15498 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAV1P15498 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAV1P15498 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAV1P15498 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAV1P15498 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAV1P15498 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAV1P15498 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAV1P15498 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAV1P15498 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAV1P15498 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAV1P15498 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAV1P15498 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VAV1P15498 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAV1P15498 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAV1P15498 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAV1P15498 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms