Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UCHL3P15374 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UCHL3P15374 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms