Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC5A1P13866 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.5 ms