Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COL6A2P12110 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
COL6A2P12110 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COL6A2P12110 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
COL6A2P12110 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL6A2P12110 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL6A2P12110 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL6A2P12110 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL6A2P12110 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COL6A2P12110 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL6A2P12110 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COL6A2P12110 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COL6A2P12110 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COL6A2P12110 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL6A2P12110 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL6A2P12110 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
COL6A2P12110 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COL6A2P12110 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL6A2P12110 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COL6A2P12110 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COL6A2P12110 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COL6A2P12110 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL6A2P12110 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL6A2P12110 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL6A2P12110 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COL6A2P12110 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COL6A2P12110 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL6A2P12110 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COL6A2P12110 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL6A2P12110 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COL6A2P12110 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COL6A2P12110 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL6A2P12110 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COL6A2P12110 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COL6A2P12110 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COL6A2P12110 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COL6A2P12110 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COL6A2P12110 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COL6A2P12110 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL6A2P12110 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL6A2P12110 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COL6A2P12110 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COL6A2P12110 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COL6A2P12110 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COL6A2P12110 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL6A2P12110 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL6A2P12110 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COL6A2P12110 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL6A2P12110 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COL6A2P12110 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COL6A2P12110 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COL6A2P12110 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL6A2P12110 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COL6A2P12110 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL6A2P12110 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COL6A2P12110 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COL6A2P12110 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COL6A2P12110 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COL6A2P12110 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COL6A2P12110 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL6A2P12110 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COL6A2P12110 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms