Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL11A1P12107 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms