Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms