Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM6P0DI80 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms