Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
C4AP0C0L4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
C4AP0C0L4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C4AP0C0L4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
C4AP0C0L4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C4AP0C0L4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C4AP0C0L4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C4AP0C0L4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms