Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PARP1P09874 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PARP1P09874 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PARP1P09874 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PARP1P09874 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PARP1P09874 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PARP1P09874 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PARP1P09874 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PARP1P09874 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PARP1P09874 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PARP1P09874 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PARP1P09874 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP1P09874 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP1P09874 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP1P09874 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP1P09874 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP1P09874 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP1P09874 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP1P09874 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP1P09874 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP1P09874 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP1P09874 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP1P09874 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP1P09874 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP1P09874 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP1P09874 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP1P09874 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP1P09874 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP1P09874 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP1P09874 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP1P09874 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP1P09874 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP1P09874 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP1P09874 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP1P09874 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP1P09874 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP1P09874 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP1P09874 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP1P09874 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP1P09874 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP1P09874 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP1P09874 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP1P09874 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP1P09874 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP1P09874 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP1P09874 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP1P09874 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP1P09874 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP1P09874 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP1P09874 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP1P09874 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP1P09874 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP1P09874 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP1P09874 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP1P09874 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP1P09874 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP1P09874 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP1P09874 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP1P09874 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP1P09874 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP1P09874 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP1P09874 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP1P09874 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP1P09874 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP1P09874 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP1P09874 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP1P09874 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP1P09874 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP1P09874 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP1P09874 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP1P09874 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP1P09874 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP1P09874 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP1P09874 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP1P09874 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP1P09874 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP1P09874 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP1P09874 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP1P09874 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP1P09874 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP1P09874 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP1P09874 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP1P09874 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP1P09874 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP1P09874 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP1P09874 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP1P09874 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP1P09874 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP1P09874 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP1P09874 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP1P09874 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PARP1P09874 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PARP1P09874 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PARP1P09874 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PARP1P09874 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PARP1P09874 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP1P09874 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP1P09874 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP1P09874 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP1P09874 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms