Protein–RNA interactions for Protein: P09341

CXCL1, Growth-regulated alpha protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL1P09341 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL1P09341 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL1P09341 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms