Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRCP08575 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
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