Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRBV12-3P01733 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms