Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1RP00736 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1RP00736 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1RP00736 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C1RP00736 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1RP00736 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1RP00736 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1RP00736 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1RP00736 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1RP00736 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1RP00736 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1RP00736 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1RP00736 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1RP00736 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1RP00736 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C1RP00736 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1RP00736 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1RP00736 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1RP00736 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1RP00736 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1RP00736 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C1RP00736 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1RP00736 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1RP00736 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1RP00736 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1RP00736 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1RP00736 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1RP00736 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1RP00736 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1RP00736 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1RP00736 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C1RP00736 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1RP00736 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C1RP00736 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1RP00736 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1RP00736 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1RP00736 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C1RP00736 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C1RP00736 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1RP00736 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1RP00736 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1RP00736 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1RP00736 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1RP00736 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1RP00736 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C1RP00736 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1RP00736 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1RP00736 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1RP00736 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1RP00736 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1RP00736 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1RP00736 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1RP00736 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1RP00736 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C1RP00736 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1RP00736 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1RP00736 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1RP00736 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1RP00736 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C1RP00736 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1RP00736 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1RP00736 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1RP00736 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1RP00736 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1RP00736 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1RP00736 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1RP00736 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1RP00736 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1RP00736 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1RP00736 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1RP00736 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1RP00736 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1RP00736 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1RP00736 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1RP00736 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1RP00736 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1RP00736 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1RP00736 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1RP00736 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1RP00736 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C1RP00736 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1RP00736 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C1RP00736 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1RP00736 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1RP00736 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1RP00736 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1RP00736 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1RP00736 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1RP00736 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1RP00736 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1RP00736 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1RP00736 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1RP00736 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1RP00736 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C1RP00736 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1RP00736 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1RP00736 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C1RP00736 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C1RP00736 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1RP00736 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms