Protein–RNA interactions for Protein: P00395

MT-CO1, Cytochrome c oxidase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-CO1P00395 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-CO1P00395 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-CO1P00395 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms