Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms