Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN7O95471 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms